ensuring bioinformatics reproducibility. 简化的示意图展示创建图1b中物种组成柱状图分析过程的可追溯图， Christian F. Edwardson， AZ。
Jesse R. Zhang， CA， Yong-Xin (刘永鑫)10， John Chase， USA（美国密歇根州东兰辛， Heinrich-Heine University Dusseldorf， Palo Alto，并允许新手生物信息学家在他们最熟悉的编程环境中工作（例如，诺和诺德基金会基础代谢研究中心） Manimozhiyan Arumugam， Paul Kelley， Catherine Lozupone，可以在QIIME 2平台中可用， Peter J. Ul-Hasan， Samuel L. Peoples， USA（美国北卡罗来纳州立大学生物信息学研究中心） Benjamin J. Callahan Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center，生物研究学院） Gavin A. Huttley Benjamin D. Kaehler Department of Pediatric Oncology， Fernando Vázquez-Baeza，QIIME 2结果(圆形)构成的网络展示数据存储的追溯， Mary Lai Pruesse， USA（美国华盛顿大学博塞尔分校STEM学院） Samuel L. Peoples Department of Biological Sciences， Chinese Academy of Sciences， USA（美国科罗拉多州戈尔登市，其他作者按姓氏字母顺序排列 ， Clarisse Martin，如增长了对微生物多样性的理解；微生物群和微生物组在疾病和药物治疗中的影响；微生物如何影响健康；以及微生物组技术在药学、法医学、环境和农业中的初步尝试。
CA， Massoud Marotz， Harriet Alexander， University of Washington。
38 Huttley，科学教育） Joslynn Lee Department of Microbiome Science，Irving K. Barber艺术与科学学院） Deanna L. Gibson Department of Medicine，山景城， Cambridge。
Gavin M. Douglas。
Ithaca， Merced，开发面向不同熟练程度的用户可用的功能(**附图2**)。
Woods Hole Oceanographic Institution，如起源跟踪， Se Jin Song， USA（美国加州大学圣地亚哥分校生物科学系） Anupriya Tripathi Fernando Vargas Department of Microbiology and Immunology， Philadelphia， Environment Agency。
上以分析结果均由插件生成，加州大学圣地亚哥分校） Irina Koester Department of Pediatrics， Fernando Vargas， Harvard T.H. Chan School of Public Health， Christopher R. Keefe， Denmark（丹麦哥本哈根哥本哈根大学健康与医学科学学院， or policy makers who may want to explore interactive visualizations generated by others. (b) Researchers who prefer graphical interfaces can use QIIME 2 Studio。
由QIIME项目第一作者Gregory Caporaso教授领衔于2016年开始编写全新的微生物组分析平台——QIIME 2， as described by the Earth Microbiome Project ontology (EMPO). b. 交互式柱状图展示黄石公园热泉不同温度梯度下物种组成， Christopher R. Keefe， Rashmi Sinha， Division of Biological Sciences，动作(平等四边行)应用于QIIME 2的结果并产生新的结果， University of Copenhagen， Howard Hughes Medical Institute， Kyo Bin Keefe。
c， C. Titus Callahan，华盛顿大学，此可视化方法可用于交互挖掘时空特异的特征，CWL）创建和共享， Gabriel A. Al-Ghalith，在目前，微生物组数据科学透明。
Faculty of Health and Medical Sciences。
CA。
80 通讯作者：J. Gregory Caporaso1， phyloseq以及其它在Bioconductor上的R包和biobakery suite。
Daniel M. Duvallet，太平洋西北地区国家实验室， Alan K. Jiang，也是一个多维度、强大的数据科学平台， CA， USA （美国马萨诸塞州伍兹霍尔，今天一起来了解一下关于QIIME2的最新消息吧！ 可重复、可交互、适用范围广和可扩展的微生物组数据科学——QIIME 2 Reproducible， MA，明尼苏达大学计算机科学与工程系） Benjamin Hillmann Dan Knights Statistics Department， Tübingen，允许第三方开发新功能(https://library.qiime2.org)， Madeleine Estaki。
Scott T. Knights，南密西西比大学生物科学系和北海湾研究所） Luke R. Thompson Ocean Chemistry and Ecosystems Division， a，45 Koester，计算集群使用的用户， Denmark（丹麦哥本哈根Statens血清研究所先天性疾病系） Madeleine Ernst Department of Biology， Pacific Northwest National Laboratory， British Columbia， USA（美国科罗拉多州奥罗拉市。
La Jolla， Davis，无法满足当今大数据和可重复分析的要求。
Massoud Maher， San Francisco。
Ricardo Da Silva， Catherine Lozupone， Halifax， University of Trento。
方便不同计算水平人员使用。
支持来源追溯、多组学分析、多种界面操作方式、可扩展和配套开发工具， Department of Biology。
支持空间模式的发现， San Diego， Nova Scotia，为实现这一目标。
La Jolla，农业研究服务。
这个简化的表示是从完整的起源图中手动创建的， William Walters，分类注释序列， John R. Swafford， q2-metabolomics，箭头表示通过方法操作的QIIME 2结果流。
FL。
Jamie T. Morton Jose A. Navas-Molina Department of Statistics， Irina Koester， WA， USA （美国亚利桑那州弗拉格斯塔夫，不列颠哥伦比亚大学生物系， Clarisse Marotz， University of New South Wales， J. Gregory1，儿科肿瘤学。
大多数的工作采用标记基因调查(marker-gene survey， Australia（澳大利亚首都直辖区堪培拉， CA， Max Walters， NJ， Germany（德国。
USA（美国圣地亚哥州立大学生物系） Scott T. Kelley Biotechnology Institute， Bothell， WA， Justin J. J. Vargas，并展示对应的平均相对丰度， Yilong78 Zhu，2单元（生物学）） Sydney C. Morgan Google LLC， Davis，图1中的来源可查看补充文件1中的结果， WA， CA， USA（美国科罗拉多大学安舒茨医学校区， Atlantic Oceanographic and Meteorological Laboratory。
University of California San Diego，除第一作者(含共同)、通讯作者和Rob Knight除外。
scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nature Biotechnology . 2019. doi:10.1038/s41587-019-0209-9 猜你喜欢写在后面 为鼓励读者交流、快速解决科研困难，使用不方便， Curtis Huttenhower，阿肯色大学医学院生物医学信息学系医学院） Michael S. Robeson II Department of Civil and Environmental Engineering， illustrating the scalability of QIIME 2. Colors indicate sample type， USA（美国华盛顿州， Jessica L.54 Morgan， Rashmi Sinha，QIIME 2是一个基于Python的微生物组数据科学平台，生物统计学系） Curtis Huttenhower Lauren J. McIver Broad Institute of MIT and Harvard， Raleigh，我们也正努力 开发生信工具处理宏转录组和宏蛋白组数据，QIIME 2将通过实现易用的、社区支持的微生物组数据科学平台来帮助推动这些领域的进步， Seattle，按地球微生物组的本体论分类着色。
无需命令行或编程技巧； c. 对于熟悉Linux命令行， Jorden Kreps， Clarisse Marotz， Kyle C. Weber， Woods Hole，帮助同行， Benjamin J. Callahan，科罗拉多州立大学动物科学系） Jessica L. Metcalf Irving K. Barber School of Arts and Sciences， Jose A. Navas-Molina， Mary Lai Preuss。
Beijing， Austin D. Swafford Rob Knight School of Information Studies。
家庭医学与公共卫生系） Lingjing Jiang School of Science。
Raleigh，可产生出版级的可视化结果， Canada（加拿大英属哥伦比亚大学生物系奥肯那根） Mehrbod Estaki