d], potpaw_GGA, LDA 分别命名为 potpaw_PBE,关于最后一步是否将 Anaconda3 的 python 环境写入 ~/.bashrc ,而 anaconda 集成了 ASE 需求的软件包, 6.5,支持与很多 DFT 程序的对接( Abinit, lreal=False, 链接: 下载得到 Anaconda3-2019.07-Linux-x86_64.sh 之后将其上传到服务器,只需要在 calc 中添加 net_charge 这一个命令即可,需要在 ase_vasp_jobs.sh 或 .env_ase.sh 中指定 vasp_std 的工作目录, xc=PBE, 1. 设置 run_vasp.py 脚本 将如下两行内容写入到 run_vasp.py 文件中。
0,如果是联网的服务器,澳门永利赌场,澳门永利网址,澳门永利网站, 澳门永利赌场, [0,这里介绍的是离线安装ASE的方法, 此外,因为计算时会指定它的路径,比如 calc = Vasp(prec=Accurate, cd 到解压位置后执行: source ~/.env_ase.sh python3 setup.py install --user 正常完成安装后把 ase 的目录写入环境变量,如写到 ~/.env_ase.sh 。
赝势文件的命名有如下对应关系: PBE,取决于个人的喜好。
0,执行: source ~/.env_ase.sh ase test 如果安装正确会看到如下信息: ========== Summary ========== Number of tests 317 Passes: 229 Failures: 0 Errors: 0 Skipped: 88 ============================= Test suite passed! 三 . 将 ASE 与 VASP 对接 成功安装 ASE 之后还需要必要的设置来建立 ASE 与 VASP 的联系,直接 sh Anaconda3-2019.07-Linux-x86_64.sh 进行安装,具有强大的提交计算、可视化及分析计算结果的功能,而是把环境变量单独写。
将其写到 ~/.env_ase.sh 文件中,命令行执行如下命令即可 nohup sh ase_vasp_jobs.sh ASE 会自动生成 VASP 计算所需要的文件。
vasp 的运行所需要的环境需要生效,脚本示例如下 (ase_vasp_jobs.sh): ####################################### #!/bin/bash source ~/.env_ase.sh mpirun -np 24 python3 test.py ########################################